南京四周群山环抱，有紫金山、牛首山、幕府山等，清凉山、狮子山、鸡笼山等聚散于市内，形成了山多水多丘陵多的地貌特征。南京城区起伏不平。紫金山中支的余脉向西延伸，在太平门旁为富贵山，进城为小九华山、北极阁，继续向西连接古长江冲积物堆成的下蜀黄土岗地，把南京城一分为二，形成了秦淮河水系和金川河水系的天然分水岭。
紫金山位于南京市玄武区境内，又称钟山、蒋山、神烈山，是江南四大名山之一，有“金陵毓秀”的美誉，是南京名胜古迹荟萃之地，世界文化遗产——明孝陵所在地，全国首批国家5A级旅游景区——钟山风景名胜区位于紫金山南麓。
紫金山主峰海拔448.9米，周围约30公里，三峰相连形如巨龙，山、水、城浑然一体，古有“钟山龙蟠，石城虎踞”之称，早在三国与汉朝就极负盛名。
牛首山，位于南京市江宁区，由牛首山、祖堂山、将军山、东天幕岭、西天幕岭、隐龙山等诸多大小山组成。牛首山属于宁镇丘陵西段南支，山高248米，因东西双峰对峙形似牛角而得名，《金陵览古》曰：“遥望两峰争高，如牛角然。”
幕府山横贯于南京市鼓楼区北端和栖霞区西端，是一座位于长江南岸边的丘陵山脉。
幕府山山峦延绵起伏，登临幕府，远望景天一色，万里长江从山下奔腾向前。清代的金陵四十八景，幕府山便有幕府登高、达摩古洞、永济江流、化龙丽地、嘉善闻经、燕矶夕照六景。
清凉山位于南京市鼓楼区清凉门内，是南京城西的丘陵山岗。清凉山古名石头山、石首山、石头城，有“六朝胜迹”之称，园内众多的名胜古迹和历史文化遗址，形成了深厚的历史文化底蕴。诸葛亮曾称金陵形势为“虎踞龙蟠”，虎踞就指今清凉山。战国时楚威王于此置金陵邑，山存有城，名石城山。三国时，东吴改筑石头城，亦名石头山。南唐时曾建避暑宫于山上，是南唐帝王避暑行宫的所在地。北宋时更名清凉山，沿用至今。
狮子山拥有众多的人文景观和历史遗迹。狮子山风景区，以狮子山为中心，包括山巅、山坡、山麓及其周围的一系列人文景观。具体来说，即以“阅江楼”为主要标志，山巅有孙中山观江亭、古炮台遗址、度假村；山坡有徐达将军庙、玩咸亭、狮字林碑刻；山麓有静海寺、三宿岩和天妃宫碑；附近还有绣球公园、小桃园、渡江胜利纪念馆、八字山、江南水师学堂遗址、孙津川故居、太平军破城处等景点。
鸡笼山位于南京市玄武区，又名北极阁，东连九华山，西接鼓楼岗，北近玄武湖，为紫金山延伸入城余脉。春秋战国时期，以其山势浑圆汕，形似鸡笼而得名。
鸡笼山高约100米，古时是金陵城中重要制高点。南朝齐武帝到钟山射雉至此闻鸡鸣，故鸡笼山又改称鸡鸣山。明初设观象台于山上，又名钦天山，清朝初年，在山上重建北极阁后，民间俗称此山为北极阁。
