夏尔希里保护区位于新疆博尔塔拉蒙古自治州境内。保护区是以保护鸟类、湿地生态系统和野生动植物资源为主的保护区。夏尔西里，为蒙语，意为“黄色的山坡”，总面积为31400公顷（314平方公里），其中西部为中高山带，面积22000公顷；中部为中低山区，面积3600公顷，是连接东西两部分的天然廊道，从而保持地区内自然环境的完整性；东部为低山和荒漠平原戈壁地带，总面积为5800公顷。
自然资源
这里海拔1210至3670米，属温带大陆性气候，境内沟壑纵横，水资源丰富。该区植物类型多样，有蒙古黄芪、雪莲、新疆紫草和国家二级重点保护动物10余种。高山带的高山草甸植被发育良好，中低山带阴坡为天山云杉为主的森林草原带，森林面积约7200公顷。阴坡为灌草型草原带，主要有忍冬、枸子、小孽和蒿类。整个区域林草植被生长茂盛，植被覆盖总面积约占97%这里野生动物资源丰富，有赛加羚羊、北山羊、盘羊、棕熊、雪豹等国家重点保护野生动物40余种，约有陆栖类动物和鸟类300余种，其中以赛加羚羊最为珍贵。
过去，这里由于长期处于中哈（原苏联）边界争议区，双方均实行严格的军事管制，基本无人类活动，保护区生态处于原始自然状态。
夏尔希里地区植被是我国内陆植被的重要组成部分，其植被发生、形成与夏尔希里地区的环境密不可分。地处我国西北部的夏尔希里地区正好位于欧亚大陆中心，自然地理几经变迁，造成了各个植物区系的接触、混合和特化，受中亚、蒙古、西伯利亚的影响，过渡明显，生物种群多样，植被组成从低等植物到高等植物，种类多样。
夏尔希里自然保护区内野生植物有1676种，分属81科513属，其中有红门兰、斑叶兰等珍稀兰科植物以及蒙古黄芪、雪莲、紫草、梭梭、甘草、肉苁蓉等国家重点保护植物60余种，还蕴藏着繁多的食用、药用、观赏、芳香、固沙、蜜源、纤维植物等植物资源，其中有许多种类是重要的生物物种基因库，据初步调查，保护区约有陆栖动物和鸟类179种，其中属 国家重点保护的动物有35种：主要为雪豹、北山羊、棕熊、猞猁、马鹿、盘羊、苍鹰、草原雕、雪鸡、雕鸮、短耳鸮等，保护区是珍稀、濒危野生动植物的天然分布区。同时，这里又是中国新疆西北部重要的鸟类迁徙地、繁殖地、越冬地，成为我国一座独特的生物基因宝库。
领土争议
保护区原为中国和哈萨克斯坦共和国的争议区，根据1998年7月4日中哈两国签署的《关于中哈国界补充规定》，中哈勘界第四组于1999年5月—1999年9月进入该区勘界，将夏尔希里地区22000公顷和阿拉山口5800公顷划归中国。
2000年6月，经自治区人民政府新政函（2000）130号文件批准成立了自治区级自然保护区，类型为森林及野生动物类型，面积220平方公里，核定人员编制15人。 2005年3月3日，经新疆维吾尔自治区人民政府同意增扩面积，将位于阿拉山口64平方公里（除去公路、铁路等6平方公里）中58平方公里和与夏尔希里自然保护区连接的博州哈日图热格林场经营区36平方公里，一并划入夏尔希里自然保护区。保护区地理坐标界于东经81°43′09″-82°33′18″，北纬45°07′43″-45°23′15″之间。保护区总面积为31400公顷。
区内无任何经济活动和常住人口，只有当地边防驻军。夏尔希里自然保护区内无居民居住和无人为的生产经营活动。沿边界有边防驻军，保护区工作人员15名（户），另聘有管护员10名，总人口46人。
