2F“起源之谜”：作为整个自然博物馆的开篇，概要地回顾了人类探索宇宙和生命起源的过程；1F “生命长河”：一条崭新的马门溪龙标本会在此呈现；B1 “恐龙盛世”：分为“演化之路”和“未来之路”。将带游客回顾生物生命演化过程中的大事件。

B2M “上海故事”：在B1和B2之间有一个微妙的夹层，集中展现我们身处的这个城市——上海无时不刻发生着的变化。这一层同时设有沧海桑田剧场。B2 “非洲大草原”：B2有五个展览主题，展示各个典型生态系统中生物群落的组成及相互间的关系。游客将走进一个个缤纷多彩的生命世界。尤其在非洲大草原展区，已经让很多先行的参观者忍不住“哇~”出声。到底有多震撼，只有等你亲自去感受了。

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