中山植物园北园以保护、研究、利用我国中、北亚热带植物为重点，建成包括植物系统分类园、蔷薇园、球宿根花卉园、药用植物园、盆景园、树木园、松柏园等10余个专类园；南园（植物博览园）是以热带植物宫为中心的植物博览园，有盲人植物园、禾草园、蕨类园、森林休闲区等特色专类园。
园区景观融知识性、趣味性、观赏性于一体，是别具一格的旅游、休闲和开展科普教育的理想场所。
中山植物园北园
北园是中国中、北亚热带的植物研究中心，拥有专类园（区）10个，设有观赏植物中心、药用植物中心、经济植物中心等以及江苏省药用植物研究开发中心、江苏省植物迁地保护重点实验室，还有华东地区较大的植物标本馆，拥有馆藏标本约70万份。还有桥世界，可供儿童玩耍。
中山植物园南园
南园又名“江苏省中国科学院植物研究所植物博览园”，进去是前湖，能远眺前湖南边的明城墙。南园主要的展区都在前湖北边，按照景观侧重点分为11个区域：热带植物宫、禾草园、盲人植物园、红枫岗景区、盆景园、蔷薇园、药物园、松柏园、树木园、植物分类系统园和南京中山植物园自然教育区，共收集活植物约3000余种。
